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提高性能有如下方法
1、Cython,用于合并python和c语言静态编译泛型
2、IPython.parallel,用于在本地或者集群上并行执行代码
3、numexpr,用于快速数值运算
4、multiprocessing,python内建的并行处理模块
5、Numba,用于为cpu动态编译python代码
6、NumbaPro,用于为多核cpu和gpu动态编译python代码
为了验证相同算法在上面不同实现上的的性能差异,我们先定义一个测试性能的函数
定义执行的算法如下
对应的数学公式是
生成数据如下
第一个实现f1是在内部循环执行f函数,然后将每次的计算结果添加到列表中,实现如下
当然实现这种方案的方法不止一种,可以使用迭代器或eval函数,我自己加入了使用生成器和map方法的测试,发现结果有明显差距,不知道是否科学:
迭代器实现
eval实现
生成器实现
map实现
接下来是使用numpy的narray结构的几种实现
上面的f5和f6只是使用的处理器个数不同,可以根据自己电脑cpu的数目进行修改,也不是越大越好
下面进行测试
测试结果如下
发现f8的时间最短,调大一下时间精度再测一次
发现使用map的性能最高,生成器次之,其他方法的性能就差的很远了。但是使用narray数据的在一个数量级,使用python的list数据又在一个数量级。生成器的原理是并没有生成一个完整的列表,而是在内部维护一个next函数,通过一边循环迭代一遍生成下个元素的方法的实现的,所以他既不用在执行时遍历整个循环,也不用分配整个空间,它花费的时间和空间跟列表的大小是没有关系的,map与之类似,而其他实现都是跟列表大小有关系的。
内存布局
numpy的ndarray构造函数形式为
np.zeros(shape, dtype=float, order='C')
np.array(object, dtype=None, copy=True, order=None, subok=False, ndmin=0)
shape或object定义了数组的大小或是引用了另一个一个数组
dtype用于定于元素的数据类型,可以是int8,int,float8,float等等
order定义了元素在内存中的存储顺序,c表示行优先,F表示列优先
下面来比较一下内存布局在数组很大时的差异,先构造同样的的基于C和基于F的数组,代码如下:
下面来测试性能
输出如下
可知,C内存布局要优于F内存布局
并行计算
未完,待续。。。
标签: python 效率优化
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