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TransUnet官方代码测试自己的数据集（已训练完毕）(transit code)

编辑：rootadmin

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首先参考上一篇的训练过程，这是测试过程，需要用到训练过程的权重。

1. TransUnet训练完毕之后，会生成权重文件（默认保存位置如下），snapshot_path为保存权重的路径。

权重文件

2. 修改test.py文件

调整数据集路径。训练和测试时的图像设置相同大小，并设置主干模型的名称同训练时一致。

TransUnet官方代码测试自己的数据集（已训练完毕）(transit code)

配置数据集相关信息。手动添加权重。

3. 设置DataLoader

设置DataLoader中参数num_workers=0。

4. 修改utils.py文件

替换utils.py中的test_single_volume函数，原网络输出的是0,1,2,3,4像素的图片，分别代表5个类别，直接显示均呈黑色。对此，我们通过像素调整，使每个类别呈现不同的颜色。

def test_single_volume(image, label, net, classes, patch_size=[256, 256], test_save_path=None, case=None, z_spacing=1): image, label = image.squeeze(0).cpu().detach().numpy(), label.squeeze(0).cpu().detach().numpy() _,x, y = image.shape if x != patch_size[0] or y != patch_size[1]: #缩放图像符合网络输入 image = zoom(image, (1,patch_size[0] / x, patch_size[1] / y), order=3) input = torch.from_numpy(image).unsqueeze(0).float().cuda() net.eval() with torch.no_grad(): out = torch.argmax(torch.softmax(net(input), dim=1), dim=1).squeeze(0) out = out.cpu().detach().numpy() if x != patch_size[0] or y != patch_size[1]: #缩放图像至原始大小 prediction = zoom(out, (x / patch_size[0], y / patch_size[1]), order=0) else: prediction = out metric_list = [] for i in range(1, classes): metric_list.append(calculate_metric_percase(prediction == i, label == i)) if test_save_path is not None: a1 = copy.deepcopy(prediction) a2 = copy.deepcopy(prediction) a3 = copy.deepcopy(prediction) a1[a1 == 1] = 255 a1[a1 == 2] = 0 a1[a1 == 3] = 255 a1[a1 == 4] = 20 a2[a2 == 1] = 255 a2[a2 == 2] = 255 a2[a2 == 3] = 0 a2[a2 == 4] = 10 a3[a3 == 1] = 255 a3[a3 == 2] = 77 a3[a3 == 3] = 0 a3[a3 == 4] = 120 a1 = Image.fromarray(np.uint8(a1)).convert('L') a2 = Image.fromarray(np.uint8(a2)).convert('L') a3 = Image.fromarray(np.uint8(a3)).convert('L') prediction = Image.merge('RGB', [a1, a2, a3]) prediction.save(test_save_path+'/'+case+'.png') return metric_list

**方便小伙伴理解这部分代码，特意做了个图，a1,a2,a3分别代表RGB三个通道，开始它们的值通过deepcopy函数直接赋值，故三者的值都是一样的。这里拿类别1举例：a1[a12]=0代表R通道中输出结果为2的赋值0， a2[a22]=255代表G通道中输出结果为2的赋值255， a3[a3==2]=77代表B通道中输出结果为2的赋值77，(0,255,77)对应就是绿色，类别2就是绿色（轮子）。然后通过Image.merge(‘RGB’, [a1, a2, a3])函数合并三个通道，此时prediction就成了三通道彩色图。